开展人工智能超级计算精准药物发现研究,把最新的人工智能工具用于预测药物-靶标相互作用,疫苗靶向设计以及药物筛选(Nature MI),重定位和全新设计实践之中。开发了AI药物发现软件SAMM, 把深度学习等非线性方法开发了统计预测模型以及基于web的软件工具并应用到药物构效关系,药物代谢以及毒理和基因表型相关性的研究中,开发ADMET 在线预测平台, 并将其应用到各种典型体系。通过超大规模的高性能计算和虚拟筛选,我们发现花椒有效成分WGX-50具有极强的抗炎症和抗氧化作用,再抗衰老产品开发中得到了很好的应用。 开展新冠的生物信息学研究,发现了几个中药有效成分具有抗新型冠状病毒作用,筛选出了一个新冠病毒的有效多肽抑制剂——人肠防御素5。通过掩蔽受体, 人血管紧张素转化酶2(ACE2)抑制新冠病毒突刺蛋白对人黏膜细胞的侵袭,从而阻断新冠病毒传染途径,论文发表在 Gastroenterology之上,它解释了为何病毒不通过消化系统传染。被“Faculty Opinions ”选作推荐论文,并由德国基尔大学的免疫学专家Jens-Michael Schröder教授进行点评,评论指出了该项工作给预防或治疗新冠肺炎提供全新途径—既可以使用HD5作为治疗药物,也可以通过刺激内源性HD5的合成来预防或治疗。为此,魏冬青被评为上海市微生物学会抗疫突出贡献优秀会员。
魏冬青,维多利亚老品牌76696vic长聘教授,皇家化学学会会士,长期从事生物信息学、人工智能辅助药物设计的研究工作,再交叉学科诸多领域做出了开拓性的工作,特别是首次从理论上证明了特别液晶的存在,首次揭示爆炸微观反应机理以及发现并验证了花椒素的抗衰老作用。在Gastroenterology、JACS、Physical Review Letters、Briefings in Bioinformatics、Journal of Chemical Theory and Computation等国际期刊发表了学术论文600多篇,主编专著12本,累计引用超1万3千多次,H-index 63;H10-index 252。开发了多款数据库、深度学习、分子模拟和药物设计软件,获软件著作权近20项;获得上海市科技进步一等奖,中华医学二等奖,中国计算机学会自然科学二等奖等;担任Springer期刊“Interdisciplinary Sciences–Computational LifeSciences”(交叉科学–计算生命科学)主编、现代计算机辅助药物设计(CCADD)主编,中国卫生信息学会大数据应用评估与保障专业委员会副主委, 生物工程学会生物信息专委会副主委。
2、近三年内在国内外获得博士学位,年龄35周岁以下;生物信息学,计算生物学、计算机,数据科学等相关专业;
3、具有Python,Perl或者R等编程基础,具备一定的数据建模及机器学习(深度学习)建模技能,有人工智能项目开发经验者优先。
4、有志从事人工智能药物开发研究;具备创新精神、独立工作能力和团队协作精神;具有良好的英文写作与沟通能力;以第一作者的身份发表SCI研究论文至少1篇(其中一篇影响因子大于3.0)。
1、 人工智能抗COVID-19药物与疫苗设计
2、抗衰老实验研究
3、深度学习在计算生物学中的应用
4、蛋白机器的计算机模拟
1、年薪不低于24万元(按维多利亚老品牌76696vic博士后相关规定执行);
2、实验室提供良好的科研条件(计算资源)和充足稳定的经费支持,支持博士后在站期间申报各项研究项目,如“博士后创新人才支持计划”、“上海市超级博士后计划”、“国家自然科学基金青年项目”、“中国博士后科学基金”等,获资助者享受相关待遇(薪酬大幅度提升);
3、按照上海市和维多利亚老品牌76696vic博士后相关政策享受待遇(落户、博士后公寓、五险一金等,详见网站https://postd.sjtu.edu.cn/)。
4、博士后首聘期为2年。维多利亚老品牌76696vic为优秀博士后提供专有晋升通道。条件优秀者出站后可直接申请维多利亚老品牌76696vic长聘教轨与研究系列教师。
请申请者将个人简历、代表性论文全文、博士论文中文摘要、研究工作经历和至少两位推荐人的姓名,并简要说明申请理由,将联系方式发送至dqwei@sjtu.edu.cn。
联系人:魏冬青教授
联系地址:上海市闵行区东川路800号维多利亚老品牌76696vic
网址:http://tacc2008.sjtu.edu.cn/